Theo cơ cấu mới, Bộ Công thương  có 21 đơn vị trực thuộc, giảm một đầu mối so với trước. Cụ thể gồm: Vụ Kế hoạch - Tài chính; Vụ Phát triển thị trường nước ngoài và Thương mại đa biên; Vụ Tổ chức cán bộ; Vụ Pháp chế; Văn phòng Bộ; Cục Năng lượng - Dầu khí; Cục Điện lực; Cục Công nghiệp; Cục Kỹ thuật an toàn và Môi trường công nghiệp; Cục Hóa chất; Cục Quản lý và Phát triển thị trường trong nước; Cục Thương mại điện tử; Cục Khoa học, Công nghệ và Chuyển đổi số; Cục Xuất nhập khẩu; Cục Phòng vệ thương mại; Cục Xúc tiến thương mại; Cục Địa chất và Khoáng sản Việt Nam và Ủy ban Cạnh tranh Quốc gia.

Cùng đó có 3 đơn vị sự nghiệp công lập gồm Viện Nghiên cứu Chiến lược, Chính sách Công thương, Báo Công thương và Tạp chí Công thương.

Mở rộng lĩnh vực quản lý của Bộ Công thương

So với Nghị định 40/2025/NĐ-CP, Nghị định 351/2026/NĐ-CP có nhiều điều chỉnh về chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Công thương.

Về phạm vi quản lý nhà nước, nghị định mới bổ sung và làm rõ một số lĩnh vực như địa chất, khoáng sản, khu công nghiệp; đồng thời quy định cụ thể hơn đối với các lĩnh vực điện, năng lượng tái tạo, dầu khí, than, tiết kiệm năng lượng, chuyển đổi số, khoa học - công nghệ, chuyển đổi xanh và giảm phát thải khí nhà kính.

Đáng chú ý, nhiệm vụ quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm có sự thay đổi về cách thức thể hiện. Trước đây, Nghị định 40/2025/NĐ-CP dành riêng khoản 15 Điều 2 để quy định cụ thể nhóm nhiệm vụ này của Bộ Công thương.

Trong khi đó, Nghị định 351/2026/NĐ-CP không còn đưa an toàn thực phẩm vào danh mục 42 nhóm nhiệm vụ tại Điều 2. Thay vào đó, tại Điều 5 về điều khoản chuyển tiếp, nghị định quy định Bộ Công thương tiếp tục thực hiện nhiệm vụ, quyền hạn quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm theo quy định của pháp luật về an toàn thực phẩm cho đến khi có quy định khác của cơ quan có thẩm quyền.