Cụ thể, Thủ tướng Chính phủ giao Phó Thủ tướng Vũ Đức Đam chỉ đạo các Bộ tham khảo kinh nghiệm quốc tế và chính sách trả lương, phụ cấp của Trường Đại học Việt - Đức, Trường Đại học Việt - Pháp, Viện nghiên cứu cao cấp về toán để hoàn thiện Quy chế tài chính của V-KIST, đảm bảo phù hợp với điều kiện thực tế của Việt Nam theo nguyên tắc: Tiền lương và phụ cấp phải gắn với kết quả công việc, hợp đồng sản phẩm, thời gian ngân sách nhà nước hỗ trợ kinh phí hoạt động thường xuyên cho Viện; chính sách ưu đãi chủ yếu tập trung cho đối tượng tham gia trực tiếp vào hoạt động khoa học và công nghệ tại Viện.
Bộ Khoa học và Công nghệ chủ trì, phối hợp với các Bộ liên quan báo cáo Chính phủ về Quy chế tài chính của V-KIST tại phiên họp Chính phủ thường kỳ tháng 3/2016.