Để khắc phục các vướng mắc trên, đồng thời bảo đảm phù hợp với việc chuyển nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu và hàng hóa kinh doanh tạm nhập, tái xuất từ đối tượng hoàn thuế sang đối tượng miễn thuế như đã nêu trên, Điều 19 dự thảo Luật Thuế xuất khẩu, Thuế nhập khẩu sẽ sửa đổi, bổ sung khoản 11 Điều 1 Luật số 21/2012/QH13, cụ thể:

Bỏ quy định về thời hạn nộp thuế của nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất xuất khẩu và hàng hóa kinh doanh tạm nhập, tái xuất.

Quy định người nộp thuế là doanh nghiệp được áp dụng chế độ ưu tiên thực hiện nộp thuế đối với hàng nhập khẩu kinh doanh theo định kỳ (các tờ khai hải quan đã thông quan hoặc giải phóng hàng trong tháng nộp thuế chậm nhất vào ngày thứ 10 của tháng kế tiếp). Theo hướng này, doanh nghiệp chỉ phải kê khai nộp thuế 1 lần, không phải trả phí bảo lãnh, không phải nộp tiền chậm nộp, giảm thời gian và chi phí cho doanh nghiệp.

Bên cạnh đó, dự thảo Luật cũng sẽ sửa quy định cách tính số tiền chậm nộp kể từ ngày được thông quan hoặc giải phóng hàng hóa đến ngày liền kề trước ngày nộp thuế.