Theo đó, Bến xe Miền Đông mới tại quận 9 sẽ chính thức vận hành ngày 10/10/2020. Để đảm bảo việc này, Sở Giao thông Vận tải yêu cầu hàng loạt cơ quan liên quan hoàn thành việc nâng cấp mở rộng đường Võ Chí Công, bố trí dải phân cách, biển báo phù hợp, bố trí vị trí cho các tuyến xe buýt ... 

Việc vận hành Bến xe Miền Đông mới dự kiến chia ở giai đoạn 1 sẽ tập trung di dời các tuyến vận tải hành khách đi - đến từ các tỉnh Quảng Trị trở ra các tỉnh phía Bắc có hành trình chạy xe đi qua Quốc lộ 1 từ Bến xe Miền Đông hiện hữu (quận Bình Thạnh) ra Bến xe Miền Đông mới.

Hành trình chạy xe đi và đến tại Bến xe Miền Đông mới như sau: Xe xuất phát từ Bến xe Miền Đông mới - QL1 (theo hướng qua cầu Đồng Nai) và ngược lại. Đối với xe đi cao tốc sẽ xuất phát từ Bến xe Miền Đông mới - đường Hoàng Hữu Nam - đường D400 - QL1 - điểm quay đầu xe trước Nghĩa trang Liệt sĩ TP - QL1 - xa lộ Hà Nội - đường D1 Khu Công nghệ cao - đường D2 Khu Công nghệ cao - cầu Phú Hữu - Vành đai 2 (đường Võ Chí Công) - Vòng xoay Phú Hữu; đường cao tốc TP.HCM - Long Thành - Dầu Giây - Ranh giới địa phận TP.HCM - tỉnh Đồng Nai và ngược lại.

Thời gian đầu di dời, xe được đón trả khách tại Bến xe Miền Đông hiện hữu trước khi Bến xe Miền Đông mới hoàn tất các thủ tục xuất bến theo quy định (thời hạn tạm thời không quá 3 tháng kể từ ngày 10/10).

Bến xe Miền Đông mới khởi công tháng 4/2017 trên diện tích 16 ha, với tổng vốn đầu tư khoảng 4.000 tỷ đồng, trong đó giai đoạn 1 khoảng 740 tỷ đồng. Toàn bộ công trình được thiết kế kiến trúc hiện đại, trở thành bến xe lớn nhất nước, có thể phục vụ hơn 7 triệu lượt khách mỗi năm. Bến xe sẽ góp phần giảm kẹt xe khu trung tâm thành phố, đặc biệt ở Bến xe Miền Đông cũ đang quá tải.

Công trình dự kiến khai thác từ Tết Nguyên đán 2018, sau đó lùi đến thời điểm này là 5 lần.