Theo đó, Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch thỏa thuận các nội dung trong dự án gồm: Nạo vét, mở rộng suối Long Vân (khu vực bến đò Hang Vò); chỉnh trang, cải tạo bến đò Hang Vò; nâng cấp, cải tạo tuyến đường nối Tam Chúc - Khả Phong vào chùa Long Vân.

Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch đề nghị UBND TP Hà Nội lưu ý chủ đầu tư việc cải tạo, mở rộng suối Long Vân từ 50m đến 80m (lớn hơn hai đến ba lần chiều rộng hiện tại) sẽ có tác động lớn đến cảnh quan thắng cảnh nên cần điều chỉnh phương án theo hướng chỉ mở rộng bến đò trong phạm vi từ Km0 đến đầu đê quai đắp đất dự kiến. Từ đoạn đầu đê quai đắp đất đến cầu vào chùa Long Vân cần nắn chỉnh, tịnh tiến về phía lòng suối, bám sát địa hình tự nhiên hiện có...

Bên cạnh đó, dự án cần làm rõ giải pháp chỉnh trang, tôn tạo cảnh quan khu vực đầu tuyến (ngã ba suối Yến - suối Long Vân) và phương án tổ chức giao thông, nhất là trường hợp đò xuất phát từ bến Hang Vò đi vào chùa Thiên Trù; Hồ sơ cần bổ sung căn cứ pháp lý thực hiện dự án (là các văn bản quy phạm pháp luật về di sản văn hóa và bảo quản, tu bổ, phục hồi di tích).

Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch cũng đề nghị UBND TP Hà Nội chỉ đạo các cơ quan liên quan hoàn thiện hồ sơ, công khai nội dung Dự án trước nhân dân để tạo sự đồng thuận trước khi phê duyệt và triển khai các bước tiếp theo theo quy định hiện hành.