Trước đó, khoảng 15h ngày 5/6, các lực lượng cứu hộ tìm kiếm qua tin báo của người dân đã phát hiện được thi thể của nạn nhân Phạm Tấn Cường (Sn 1970, trú ở Bình Định). Vị trí phát hiện tại khu vực bờ biển đường Nguyễn Tất Thành (Q. Thanh Khê), cách vị trí bờ biển phía trước Bệnh viện Ung bướu Đà Nẵng 1km, cách vị trí chìm tàu khoảng 8km.
Đến 17h, thi thể của hai cháu bé mất tích còn lại là cháu Trịnh Thị Kim Phượng (SN 2009) và cháu Trịnh Tiến Huy (2012) cũng đã được phát hiện tại khu vực gần cầu Thuận Phước trên dòng sông Hàn, cách vị trí chìm tàu 800m về hướng cửa biển.
Lúc này, lãnh đạo UBND Thành phố Đà Nẵng đã thông báo kết thúc cuộc tìm kiếm, rút hết các lực lượng cứu nạn đồng thời chỉ đạo các lực lượng chức năng tích cực hỗ trợ gia đình các nạn nhân tử vong lo công tác hậu sự cho nạn nhân.
UBND Thành phố Đà Nẵng cũng gửi lời xin lỗi, bày tỏ sự chia sẻ sâu sắc đến các nạn nhân, gia đình nạn nhân và lấy làm tiếc về vụ việc đã xảy ra, đồng thời biểu dương và cảm ơn các lực lượng đã tích cực tham gia cứu nạn vào tối ngày 4 và rạng sáng ngày 5/6/ gồm: quân đội, công an, ngư dân, y tế …, đặc biệt là đông đảo các ngư dân và tàu du lịch.