Theo quyết định đưa vụ án ra xét xử của Tòa án Nhân dân TP.HCM, các tội danh xét xử gồm: "vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng", "đưa hối lộ", "nhận hối lộ", "lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ".

Trong 14 bị cáo liên quan đến vụ án, có 4 bị cáo đang bị truy nã gồm: bà Nguyễn Thị Thanh Nhàn (Chủ tịch AIC), Trần Mạnh Hà (cựu Phó tổng giám đốc AIC); Trần Đăng Tấn (cựu Trưởng văn phòng đại diện AIC tại TP.HCM); Đỗ Vân Trường (cựu Tổng giám đốc Công ty CO Mopha, thuộc hệ sinh thái AIC).

Tòa án Nhân dân TP.HCM đã thông báo kêu gọi 4 bị cáo này ra đầu thú để được hưởng chính sách khoan hồng, đảm bảo quyền bào chữa, quyền tự bào chữa theo quy định. Trong trường hợp không ra trình diện hoặc đầu thú thì coi như các bị cáo từ bỏ quyền tự bào chữa và sẽ bị xét xử vắng mặt.

Các bị cáo đưa ra xét xử hôm nay gồm có: Dương Hoa Xô (cựu Giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học TP.HCM); Trần Thị Bình Minh (cựu Phó Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư TP.HCM), Phan Tất Thắng (cựu Phó Trưởng phòng kinh tế ngành, Sở Kế hoạch và Đầu tư TP.HCM). 

 Theo cáo trạng, năm 2006, UBND TP.HCM chấp thuận chủ trương dự án đầu tư mua sắm trang thiết bị 12 phòng thí nghiệm thuộc Trung tâm Công nghệ sinh học (gọi tắt dự án). 

Năm 2014, Sở Kế hoạch và Đầu tư phê duyệt dự án, trong đó chi phí mua thiết bị hơn 425 tỷ đồng. Năm 2017, dự án được điều chỉnh, kinh phí mua thiết bị tăng lên hơn 468 tỷ đồng. Dự án chia làm 3 giai đoạn với 10 gói thầu, thực hiện kéo dài từ năm 2015 - 2019. Công ty AIC và các công ty được AIC chỉ định đã "thâu tóm" 6 gói thầu, và Công ty CP công nghệ cao Gene Việt liên doanh với AIC để trúng 2 gói thầu.

Cụ thể, sau khi tiếp cận được chủ đầu tư là ông Dương Hoa Xô, cựu Giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học, bị cáo Nhàn và bị cáo Xô thống nhất phía Trung tâm Công nghệ sinh học tạo điều kiện để AIC thực hiện các gói thầu tại dự án và phía bà Nhàn sẽ chi tiền cảm ơn ông Xô.

Qua đó, Trung tâm Công nghệ sinh học đồng ý cho Công ty Gene Việt, Công ty Việt Á (có 10% vốn góp của Công ty Gene Việt) liên danh cùng AIC thực hiện 3 gói thầu; chỉ đạo cấp dưới thông thầu tạo điều kiện cho AIC và các công ty do AIC chỉ định, tham gia đấu thầu, trúng thầu; thiết lập các công ty "quân xanh", "quân đỏ" để AIC trúng 8 gói thầu, gây thiệt hại cho nhà nước hơn 94 tỷ đồng.

Sau khi trúng thầu, bị cáo Nhàn chỉ đạo Trần Mạnh Hà, Trần Đăng Tấn đưa cho bị cáo Dương Hoa Xô tổng số tiền 14,4 tỷ đồng để cảm ơn. Sau khi nhận tiền, bị cáo Dương Hoa Xô đưa cho bị cáo Trần Thị Bình Minh (cựu Phó giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư TP.HCM) 1 tỷ đồng; Nguyễn Đăng Quân, cựu Giám đốc Trung tâm Công nghệ sinh học, 950 triệu đồng; Nguyễn Viết Thạch (cựu Trưởng ban Quản lý đầu tư xây dựng công trình thuộc trung tâm) 1,1 tỷ đồng; còn lại 11,35 tỷ đồng bị cáo Xô sử dụng vào mục đích cá nhân. 

Riêng bị cáo Trần Thị Bình Minh còn nhận 900 triệu đồng từ AIC đưa, vì vậy tổng số tiền bị cáo Minh hưởng lợi 1,9 tỷ đồng. Hiện bị cáo Dương Hoa Xô đã nộp lại toàn bộ 11,35 tỷ đồng nhận hối lộ.

Theo quyết định xét xử, bị cáo Xô bị truy tố về tội "nhận hối lộ", 2 bị cáo Trần Thị Bình Minh, Phan Tất Thắng bị truy tố về tội "lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ"; 

Nhóm bị cáo còn lại là Nguyễn Đăng Quân, Nguyễn Viết Thạch, Nguyễn Trần Long (cựu chuyên viên Ban Quản lý đầu tư xây dựng công trình thuộc trung tâm), Trần Vinh Vũ - cựu Giám đốc Công ty Hồng Hà, Nguyễn Minh - cựu Phó tổng giám đốc Công ty TNHH kiểm toán và dịch vụ tin học TP.HCM - AISC, Hồ Tấn Mạnh - cựu Tổng giám đốc Công ty thẩm định giá SEAAC, Huỳnh Tấn Vĩnh - cựu Giám đốc Công ty cổ phần Tư vấn Nguyên Châu - bị xét xử về tội "vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng".