Cục Hải quan cho biết, đối với các doanh nghiệp đã thông báo cơ sở sản xuất, hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng gia công tại cơ quan hải quan cửa khẩu hoặc ngoài cửa khẩu trước ngày 1/2/2026 - thời điểm Thông tư số 121/2025/TT-BTC có hiệu lực - và tiếp tục lựa chọn làm thủ tục tại địa điểm này, cơ quan hải quan sẽ tra cứu toàn bộ thông tin liên quan trên hệ thống GCSXXK-WEB để xử lý tờ khai xuất nhập khẩu theo quy định.

Khi có thay đổi về thông tin cơ sở sản xuất, hợp đồng hoặc phụ lục hợp đồng gia công, doanh nghiệp thực hiện thông báo cho cơ quan Hải quan quản lý địa bàn nơi có cơ sở sản xuất theo hướng dẫn tại Công văn số 8444/CHQ-GSQL ngày 2/2/2026. Trường hợp cơ sở sản xuất đã được kiểm tra và xác nhận đủ điều kiện, cơ quan Hải quan sẽ không thực hiện kiểm tra lại, trừ trường hợp phải kiểm tra theo quy định.

Đối với doanh nghiệp có năm tài chính kết thúc sau khi Thông tư số 121/2025/TT-BTC có hiệu lực, báo cáo quyết toán được nộp cho cơ quan Hải quan quản lý địa bàn nơi có cơ sở sản xuất. Báo cáo bao gồm cả dữ liệu tờ khai xuất nhập khẩu đã thực hiện tại các cơ quan hải quan cửa khẩu hoặc ngoài cửa khẩu trước đây.

Riêng các hợp đồng gia công của doanh nghiệp chế xuất thuê doanh nghiệp nội địa gia công tiếp tục thực hiện theo quy định hiện hành cho đến hết kỳ quyết toán năm 2026.

Cục Hải quan cũng lưu ý, trong thời gian hệ thống công nghệ thông tin chưa được nâng cấp, doanh nghiệp tiếp tục sử dụng mẫu báo cáo quyết toán theo quy định hiện hành; các nội dung mới phát sinh được khai bổ sung tại cột "Ghi chú".

Đáng chú ý, đối với hoạt động gia công hàng hóa cho doanh nghiệp chế xuất, doanh nghiệp nội địa được chủ động lựa chọn địa điểm làm thủ tục hải quan. Cụ thể, doanh nghiệp có thể thực hiện thủ tục nhập khẩu nguyên liệu, vật tư, máy móc, thiết bị và xuất khẩu sản phẩm tại cơ quan Hải quan nơi đặt trụ sở chính, cơ sở sản xuất, chi nhánh hoặc tại cơ quan Hải quan quản lý doanh nghiệp chế xuất, tùy theo nhu cầu và điều kiện thực tế.