Trong phần luận tội, Viện Kiểm sát Nhân dân TP. Hà Nội xác định, dù biết rõ Công ty AIC không đủ năng lực, nhưng để trúng thầu tại dự án Bệnh viện Đa khoa Đồng Nai, bị cáo Nhàn đã thiết lập mối quan hệ với lãnh đạo địa phương và dùng nhiều thủ đoạn gian lận để tham gia đấu thầu và trúng 16 gói thầu tại dự án.

Trong quá trình thực hiện dự án, Nhàn và Trần Mạnh Hà, cựu Phó tổng giám đốc Công ty AIC đã nhiều lần đưa hối lộ với số tiền 43,8 tỉ đồng cho Trần Đình Thành, cựu Bí thư Tỉnh ủy Đồng Nai; Đinh Quốc Thái, cựu Chủ tịch UBND tỉnh Đồng Nai, và Phan Huy Anh Vũ, cựu Giám đốc Bệnh viện Đa khoa Đồng Nai để nhờ chỉ đạo, tác động trúng thầu.

Khi biết sự việc vỡ lở, Nguyễn Thị Thanh Nhàn đã chỉ đạo nhân viên tiêu hủy hồ sơ và bỏ trốn. Hiện, bị cáo Nhàn và 7 đồng phạm khác trong vụ án đang bỏ trốn, bị truy nã quốc tế. Tuy nhiên, các bị cáo này vẫn bị truy tố và đưa ra xét xử vắng mặt.

Từ những lời khai của các bị cáo liên quan trong vụ án và các chứng cứ, tài liệu thu thập được, có đủ căn cứ xác định bị cáo Nhàn đã cấu kết với các đơn vị kiểm tra, giám sát, lập hồ sơ, thẩm định giá; huy động "quân xanh, quân đỏ" tham gia đấu thầu; chỉ đạo kế toán chỉnh sửa hồ sơ tài chính để gian lận trong đấu thầu. Các hành vi của bị cáo Nhàn gây thiệt hại 152 tỷ đồng cho Nhà nước.

Từ những căn cứ trên, đại diện Viện Kiểm sát Nhân dân TP. Hà Nội đề nghị HĐXX tuyên bị cáo Nguyễn Thị Thanh Nhàn từ 16 - 17 năm tù về tội “Đưa hối lộ” và từ 14 - 15 năm tù về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, tổng hình phạt là 30 năm tù.

Cũng về hai tội danh như Nhàn, bị cáo Trần Mạnh Hà, cựu Phó tổng giám đốc Công ty AIC bị đề nghị mức án từ 13 - 14 năm tù về tội “Đưa hối lộ” và 12 - 13 năm tù về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, tổng hình phạt từ 25 - 27 năm tù.

Viện Kiểm sát cũng đề nghị mức án đối với Phan Huy Anh Vũ, cựu Giám đốc Bệnh viện Đa khoa Đồng Nai, cựu Giám đốc Sở Y tế tỉnh Đồng Nai từ 9 - 10 năm tù về tội “Nhận hối lộ” và từ 10 -11 năm tù về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, tổng mức hình phạt đề nghị từ 19 - 21 năm tù cho cả 2 tội danh.

Bồ Ngọc Thu, cựu Giám đốc Sở KH&ĐT tỉnh Đồng Nai bị đề nghị mức án từ 4 - 5 năm tù về tội “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ”; Trịnh Huy Cường, cựu Trưởng phòng Quản lý xây dựng (Sở Xây dựng tỉnh Đồng Nai) bị đề nghị mức án từ 30 - 36 tháng tù về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”, cho hưởng án treo.

Đối với 29 bị cáo bị truy tố về tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”, Viện Kiểm sát đề nghị các mức án lần lượt như sau:

1. Hoàng Thị Thúy Nga, cựu Phó tổng giám đốc Công ty AIC, từ từ 8 - 9 năm tù.

2. Đỗ Văn Sơn, cựu Kế toán trưởng Công ty AIC, từ 7 - 8 năm tù.

3. Hoàng Thế Quỳnh, nhân viên Công ty AIC, từ 6 - 7 năm tù.

4. Nguyễn Tiến Thu, nhân viên Công ty AIC, 3 - 4 năm tù.

5. Nguyễn Quang Minh, nhân viên Công ty AIC, 3 - 4 năm tù.

6. Nguyễn Tấn Sỹ, kỹ sư Công ty CP tri thức và công nghệ cao quốc tế, từ 3 - 4 năm tù.

7. Lê Chí Tuân, Trưởng nhóm hồ sơ Ban Quản lý dự án 1 (Công ty AIC), từ 4 - 5 năm tù.

8. Lê Thị Hương, cựu Phó ban Kế toán (Công ty AIC), từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.

9. Lưu Văn Phương, nhân viên Công ty AIC, từ 3 - 4 năm tù.

10. Nguyễn Công Tiến, cựu Tổng giám đốc Công ty thẩm định giá Thế hệ mới, 6 - 7 năm tù.

11. Ninh Văn Sinh, chuyên viên thẩm định giá Công ty thẩm định giá Thế hệ mới, từ 5 - 6 năm tù.

12. Nguyễn Thị Dung, cựu Giám đốc Công ty Mediconsult Việt Nam, từ 5 - 6 năm tù.

13. Vũ Quang Ngọc, cựu Phó giám đốc Công ty Mediconsult Việt Nam, từ 4 - 5 năm tù.

14. Phan Minh Trí, cựu Trưởng phòng Hành chính (Bệnh viện đa khoa Đồng Nai) 7 - 8 năm tù.

15. Cao Thị Tám, cựu Trưởng phòng thuộc Trung tâm Tư vấn xây dựng (Sở Xây dựng tỉnh Đồng Nai), từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.

16. Phan Thành An, cựu Trưởng phòng Quản lý dự án, đấu thầu (Trung tâm Kiểm định và tư vấn xây dựng Đồng Nai), từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.

17. Lê Lâm Đồng, cựu nhân viên Phòng Quản lý dự án, đấu thầu (Trung tâm Kiểm định và tư vấn xây dựng Đồng Nai), từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.

18. Nguyễn Thành Thái, nhân viên Trung tâm Tư vấn xây dựng Đồng Nai, từ 4 - 5 năm tù.

19. Nguyễn Quang Vinh, kỹ sư Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng Đồng Nai, từ 3 - 4 năm tù.

20. Nguyễn Thị Nhung, cựu Phó giám đốc phụ trách Trung tâm Tư vấn xây dựng Đồng Nai, từ 6 - 7 năm tù.

21. Chu Văn Hiếu, Phó giám đốc Trung tâm Khuyến công và tư vấn phát triển công nghiệp (Sở Công thương tỉnh Đồng Nai), từ 3 - 4 năm tù.

22. Nguyễn Thị Sen, cựu Giám đốc Công ty CP Thiết bị y tế và môi trường, 4 - 5 năm tù.

23. Nguyễn Thị Tích, Tổng giám đốc Công ty MOPHA, từ 5 - 6 năm tù.

24. Ngô Thế Vinh, Giám đốc Công ty nha khoa Việt Tiên, từ 4 - 5 năm tù.

25. Nguyễn Đăng Thuyết, cựu Giám đốc Công ty Thành An Hà Nội, từ 3 - 4 năm tù.

26. Lê Thị Bích Thuỷ, Giám đốc Công ty TNT, từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.

27. Huỳnh Tuấn Anh, Giám đốc Công ty TNHH Tạ Thiên Ân, từ 4 - 5 năm tù.

28. Đỗ Mỹ Hạnh, Chủ tịch HĐQT Công ty Cát Vân Sa, từ 6 - 7 năm tù.

29. Nguyễn Văn Bằng, cựu Giám đốc Công ty Tâm Hợp, từ 30 - 36 tháng tù, cho hưởng án treo.