Tổng cục Thuế cho biết, có một số vướng mắc trong quá trình thi hành Luật Doanh nghiệp và Luật Quản lý thuế, liên quan đến việc phối hợp quản lý mã số doanh nghiệp giữa cơ quan thuế và cơ quan đăng ký kinh doanh.

Sau khi xin ý kiến, được sự thống nhất của Bộ Kế hoạch và Đầu tư và được sự đồng ý của Bộ Tài chính, Tổng cục Thuế đã có công văn hướng dẫn các cục thuế xử lý các vướng mắc này.

Theo đó, về việc xử lý hồ sơ đăng ký tạm ngừng kinh doanh của doanh nghiệp, cơ quan đăng ký kinh doanh có trách nhiệm thông báo cho cơ quan thuế cùng với thời điểm thông báo cho doanh nghiệp. Cơ quan thuế thực hiện biện pháp xử lý theo quy định đối với các khoản thuế doanh nghiệp còn nợ ngân sách nhà nước (nếu có).

Đối với việc thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, áp dụng quy định tại Khoản 2 Điều 165 Luật Doanh nghiệp và Khoản 1 Điều 59 Nghị định số 43/2010/NĐ-CP ngày 15/4/2010 của Chính phủ về đăng ký doanh nghiệp. Trường hợp cơ quan thuế thực hiện biện pháp cưỡng chế thi hành quyết định hành chính thuế thì cơ quan thuế gửi văn bản đề nghị cưỡng chế đến cơ quan đăng ký kinh doanh để phối hợp quản lý nhà nước về doanh nghiệp. Cơ quan đăng ký kinh doanh tiếp nhận thông tin, đồng thời ghi chú cảnh báo thông tin trên Hệ thống thông tin đăng ký doanh nghiệp quốc gia đối với các trường hợp này.

Đối với chi nhánh hạch toán phụ thuộc không trực tiếp kê khai, nộp thuế với cơ quan thuế quản lý nơi chi nhánh đặt trụ sở, thì trong hồ sơ chấm dứt hoạt động của chi nhánh phải có giấy xác nhận của cơ quan thuế quản lý trụ sở chính về việc chi nhánh hạch toán phụ thuộc, kê khai tập trung với trụ sở chính.

Duy Hữu