Toàn tỉnh Phú Yên hiện có 4.097 tàu cá được đăng ký và 119 tổ đội sản xuất trên biển được thành lập với 926 tàu/7.942 lao động trực tiếp.
Theo Chi cục Thủy sản (Sở NN-PTNT), cho biết: Sản lượng khai thác biển trên địa bàn tỉnh Phú Yên trong năm 2019 khoảng 62.410 tấn (tăng 3% so với năm 2018), trong đó cá ngừ đại dương khoảng 3.720 tấn (giảm 5,4% so với năm 2018).
Nguyên nhân sản lượng cá ngừ đại dương giảm là do số lượng tàu hoạt động vùng khơi giảm mạnh (hiện nay tỉnh Phú Yên còn 451 tàu đánh bắt thủy sản có chiều dài từ 15m trở lên được cấp phép khai thác hải sản vùng khơi; 730 tàu cá có công suất trên 90CV có chiều dài dưới 15m không được cấp phép, các tàu này trước đây đánh bắt ở vùng khơi nay phải đánh bắt ở vùng lộng hoặc ven bờ).
Các tàu câu cá ngừ đại dương khai thác sản lượng đạt trung bình từ 0,8-2 tấn/tàu/chuyến, trong đó khoảng 60% tàu câu có lãi, còn lại là hòa vốn, một số ít tàu khai thác bị lỗ phí tổn.
Năm 2020, mục tiêu sản lượng khai thác thủy sản của Phú Yên khoảng 55.000 tấn, trong đó cá ngừ đại dương khoảng 4.500 tấn. Để đạt được mục tiêu này, tỉnh tiếp tục triển khai các chính sách phát triển thủy sản theo hướng bền vững, gắn với bảo vệ chủ quyền, an ninh vùng biển đảo của Tổ quốc. Tỉnh Phú Yên khuyến khích ngư dân đầu tư các trang thiết bị hỗ trợ khai thác với công nghệ hiện đại, từng bước đổi mới công nghệ khai thác và bảo quản sản phẩm sau khai thác nhằm gia tăng giá trị cho sản phẩm.