Ban quản lý Khu công nghệ cao Hòa Lạc là tổ chức trực thuộc Bộ Khoa học và Công nghệ, thực hiện chức năng quản lý nhà nước trực tiếp đối với Khu Công nghệ cao Hòa Lạc theo quy định của pháp luật. 

Như vậy, đến thời điểm hiện tại, cơ cấu lãnh đạo của Bộ Khoa học và Công nghệ hiện có 7 đồng chí gồm: Bộ trưởng Nguyễn Quân, Thứ trưởng Trần Việt Thanh, Thứ trưởng Trần Văn Tùng, Thứ trưởng Trần Quốc Khánh, Thứ trưởng Phạm Công Tạc, Thứ trưởng Chu Ngọc Anh và tân Thứ trưởng Phạm Đại Dương.