Theo định hướng phát triển, Hà Nội sẽ tập trung đầu tư xây dựng các tổ hợp công trình y tế chất lượng cao có tầm cỡ quốc gia và quốc tế, đồng thời phát triển hệ thống y tế theo hướng tiên tiến, hiện đại, mở rộng quy mô các bệnh viện đa khoa nhằm nâng cao chất lượng khám chữa bệnh cho người dân.

Thành phố đặt mục tiêu đến năm 2035, hệ thống y tế Thủ đô trở thành trung tâm y tế, khoa học công nghệ và chuyển đổi số hiện đại, người dân được tiếp cận các dịch vụ chăm sóc sức khỏe chất lượng cao, các chỉ số về thể lực, tầm vóc, tuổi thọ và chất lượng sống tiếp tục được cải thiện. 

Đến năm 2045, Hà Nội phấn đấu trở thành trung tâm y tế lớn của cả nước và khu vực, hình thành mạng lưới bệnh viện và trung tâm chuyên sâu đạt chuẩn quốc tế.

Xa hơn, đến năm 2065, hệ thống y tế Thủ đô sẽ phát triển theo hướng chuyên sâu, đồng thời thực hiện cải cách mạnh mẽ về tài chính y tế nhằm bảo đảm hiệu quả và tính bền vững của chính sách bảo hiểm y tế. Tầm nhìn 100 năm đặt mục tiêu xây dựng một hệ thống khám chữa bệnh và phòng chống dịch bệnh hiện đại, công bằng, hiệu quả và bền vững.

Một điểm đáng chú ý trong quy hoạch là chủ trương di chuyển các cơ sở y tế điều trị các bệnh truyền nhiễm hoặc bệnh có mức độ lây nhiễm cao ra khỏi khu vực nội đô. Việc này nhằm giảm nguy cơ lây lan dịch bệnh trong khu vực dân cư đông đúc, đồng thời tạo điều kiện phát triển các cơ sở y tế chuyên sâu với quy mô và hạ tầng phù hợp hơn.

Thành phố cũng dự kiến ưu tiên quỹ đất để phát triển đồng bộ các cơ sở nghiên cứu, đào tạo và khám chữa bệnh chất lượng cao, đồng thời tiếp nhận một số bệnh viện của các bộ, ngành đang hoạt động trên địa bàn.

Bên cạnh nguồn vốn ngân sách, Hà Nội định hướng huy động thêm các nguồn lực xã hội để phát triển hệ thống y tế. Thành phố khuyến khích đầu tư xây dựng mạng lưới cơ sở khám chữa bệnh chất lượng cao, thúc đẩy sự phát triển của các bệnh viện tư nhân hiện đại và tăng cường hợp tác giữa khu vực y tế công lập với khu vực tư nhân nhằm nâng cao hiệu quả cung cấp dịch vụ chăm sóc sức khỏe cho người dân.

Không chỉ quy hoạch lĩnh vực y tế, đồ án quy hoạch tổng thể Thủ đô còn đưa ra định hướng quan trọng đối với hệ thống giáo dục đại học. Theo đó, tại khu vực đô thị trung tâm Hà Nội sẽ không xây mới các cơ sở giáo dục đại học.

Thành phố dự kiến giữ lại những trường đại học đã được đầu tư đồng bộ cơ sở chính và có khả năng chuyển đổi thành trung tâm đào tạo trình độ cao, trung tâm nghiên cứu và chuyển giao công nghệ hoặc trung tâm khởi nghiệp. Trong khi đó, các cơ sở thứ hai của các trường sẽ được bố trí tại khu vực khác để tổ chức đào tạo, thực hành và xây dựng khu lưu trú cho sinh viên.

Đối với những trường đại học, cao đẳng có diện tích nhỏ hoặc cơ sở vật chất không đáp ứng yêu cầu, Hà Nội sẽ thực hiện di dời toàn bộ ra khỏi khu vực nội đô.

Thành phố sẽ hỗ trợ xây dựng hạ tầng tại địa điểm mới, đồng thời sử dụng các cơ sở cũ trong nội đô cho giáo dục phổ thông hoặc các mục đích công cộng.

Theo chuẩn cơ sở giáo dục đại học của Bộ Giáo dục và Đào tạo, đến năm 2030, các trường đại học phải đảm bảo diện tích đất bình quân tối thiểu 25 m² cho mỗi sinh viên chính quy và diện tích sàn không dưới 2,8 m²/người học.

Sau khi di dời, Hà Nội sẽ hình thành mạng lưới các trường đại học và cao đẳng phân bố tại các đô thị vệ tinh, đặc biệt là khu vực phía tây với hạt nhân là Hòa Lạc.

Tại đây sẽ hình thành các quần thể đại học hiện đại với hệ thống hạ tầng và không gian chung đồng bộ tại các khu vực như Hòa Lạc - Xuân Mai, Thạch Thất, Sơn Tây và Sóc Sơn, góp phần tạo nên các đô thị đại học quy mô lớn trong tương lai.